Ο σχεδιασμός ενός σχολικού κήπου δεν είναι μια εύκολη υπόθεση. Οφείλει να λάβει κανείς υπόψη του μια σειρά από παραμέτρους που έχουν να κάνουν με τη διαχείριση του διαθέσιμου χώρου, τη διαμόρφωσή του και τη λειτουργική του προσέγγιση. Ακόμα και αν ο σχεδιασμός είναι συστηματικός από τα πρώτα του στάδια, πάντοτε προκύπτουν βελτιωτικές παρεμβάσεις κατά της διάρκεια ανάπτυξης και κατασκευής του σχολικού κήπου και τα σχέδια επαναπροσδιορίζονται και αλλάζουν, ενδεχομένως σε σημαντικό βαθμό. Μια γενικότερη συμβουλή θα ήταν, ακόμα και αν υπάρχουν εξαρχής διαθέσιμοι οι πόροι για την ολοκλήρωση της κατασκευής ενός σχολικού κήπου, εντούτοις κρίνεται μάλλον σοφότερο αναπτυξιακά και λειτουργικά να κατασκευαστεί ο κήπος σταδιακά, προκειμένου να δοθεί ο απαραίτητος χρόνος βίωσης και εμπειρίας του με μαθητές και εκπαιδευτικούς, ώστε να βελτιστοποιηθεί η κατασκευαστική του δυναμική μέσα στο συγκεκριμένο χωρόχρονο.
Το αρχικό σχέδιο του σχολικού έτους 2006-2007 περιλάμβανε πολλά χτιστά υπερυψωμένα παρτέρια σε διάφορες διαστάσεις και ορθογώνια σχήματα. Στη μέση του κήπου υπήρχε η ιδέα να φυτευτούν 6 δένδρα, κυρίως εσπεριδοειδή, με τα υπερυψωμένα παρτέρια δεξιά και αριστερά τους. Είχε γίνει πρόβλεψη για παροχή νερού σε κάθε παρτέρι, με υπογειοποιημένα λάστιχα ποτίσματος που θα βρίσκονταν κάτω από τους ενδιάμεσους διαδρόμους κίνησης. Στη νότια μεριά του κήπου θα κατασκευάζονταν ένας κεντρικός διάδρομος, σε όλο το μήκος του, με πλάτος 75-80 εκ. Όλοι οι διάδρομοι κίνησης θα καλύπτονταν με πανί εδαφοκάλυψης και με ψιλό χαλίκι. Στην ανατολική μεριά θα διαμορφώνονταν ένας υπερυψωμένος κήπος με τις δύο ελιές, που ήταν από παλιά φυτεμένες εκεί. Κάτω από τη νότια μεγάλη ελιά θα διαμορφώνονταν ο χώρος της κομποστοποίησης με δύο μέρη. Στην ανατολική μεριά υπήρχε πρόβλεψη για τη δημιουργία μιας λιμνούλας, με ανάλογα φυτά και ενδεχομένως με ψάρια, ως μια προσέγγιση μικρού υδάτινου οικοσυστήματος στο χώρο του σχολικού κήπου. Στη βόρεια μεριά, έξω από την περίφραξη του κήπου είχε σχεδιαστεί η κατασκευή υπερυψωμένων παρτεριών με αναρριχώμενα φυτά, τα οποία θα έπλεκαν πάνω στο πλέγμα του φράκτη. Όμοια στη νότια μεριά του κήπου, όπου υπάρχει ένα ψηλό τοιχίο στο μεγαλύτερο μέρος του, είχε σχεδιαστεί να κατασκευαστούν επίσης υπερυψωμένα παρτέρια με αναρριχώμενα φυτά που θα έπιαναν με πλέγμα πάνω στο τοιχίο. Διαπιστώσαμε, όμως, ότι δεν είχαμε σχεδιάσει ένα κομμάτι ανοιχτού χώρου μέσα στον κήπο και το κυριότερο δεν είχαμε συμπεριλάβει την κατασκευή ενός θερμοκηπίου, το οποίο κρίθηκε αναγκαίο αμέσως μετά τον πρώτο κύκλο καλλιέργειας των φυτών. Έτσι, σχεδιάσαμε ξανά τα παρτέρια του κήπου και κάναμε μια αναδιάταξη του χώρου, όπως φαίνεται και στο αντίστοιχο σχέδιο παρακάτω.
Το τελικό σχέδιο που διαμορφώθηκε στις αρχές του 2009, περιλάμβανε ένα θερμοκήπιο με μεταλλικό σκελετό και κάλυψη με πολυκαρμπονικά φύλλα, το οποίο εισάγαμε από την Αγγλία, μέσω μιας χορηγίας που δόθηκε στο σχολείο. Μέσα στο θερμοκήπιο τοποθετήθηκαν ράφια με στραντζαριστό σκελετό 1χ1 εκ. και με διάφανα πολυκαρμπονικά 1 εκ., πάνω στα οποία τοποθετούνται περιοδικά τα κεσεδάκια με τα σπορόφυτα. Τα χτιστά παρτέρια, ο αποκαλούμενος από τα παιδιά λαβύρινθος, τελειοποιήθηκαν με επίχρισμα σοβά μιας στρώσης, που ήταν ανακατεμένος με χρωστικές ουσίες σε σκόνη γήινων αποχρώσεων (καφέ, ώχρα και κεραμιδί). Από τη δυτική μεριά του θερμοκηπίου κατασκευάστηκαν τέσσερα ξύλινα παρτέρια εσωτερικών διαστάσεων 210χ 120, από ξύλινα δοκάρια πεύκου διαστάσεων 3,30χ13χ5 εκ., τα οποία είχαν υποστεί κατάλληλη επάλειψη από υδατοδιαλυτό τζελ ξύλου για αδιαβροχοποίηση και είχαν βαφεί με καρυδί οικολογικό υδατοδιαλυτό βερνίκι. Ανάμεσα τους υπάρχουν διάδρομοι πλάτους 60 εκ., στρωμένοι με ψιλό χαλίκι. Στη μέση του κήπου κατασκευάστηκαν δύο τετράγωνα παρτέρια και φύτεψαν τα παιδιά μια λεμονιά και μια ροδιά αντίστοιχα. Στην ανατολική μεριά του υπερυψωμένου κήπου κατασκευάστηκαν δύο σκαλοπάτια και δύο μικρά τριγωνικά παρτέρια με αρωματικά φυτά. Η μικρότερη ελιά δεν κατάφερε να προσαρμοστεί μετά από το μπάζωμα που έγινε εκεί στο χώρο και ξεράθηκε, οπότε και αντικαταστάθηκε με μια πορτοκαλιά βαλέντσια. Η λιμνούλα στην ανατολική μεριά του κήπου δεν έχει ακόμα κατασκευαστεί, αν και πλέον υπάρχουν εναλλακτικές ιδέες για τη χρήση εκείνου του χώρου …